5.01 - ARRIVAL

Tendo sido transportado para a Fortaleza da Solidão, Clark é desafiado por Jor-El, que diz que ele não pode retornar para Smallville, ao invés disso, ele deve ficar e se preparar para salvar o planeta. Também, transportada para a fortaleza, Chloe é incapaz de agüentar a temperatura abaixo de zero e desmaia, implorando para Clark usar seus poderes para salvá-la. Jor-El o proíbe de ir embora, mas finalmente concorda, dizendo para Clark que ele deve retornar antes do pôr do sol ou haverá conseqüências terríveis. Enquanto isso, Lana fica horrorizada quando vê dois alienígenas kryptonianos saírem de uma nave descoberta nos destroços da chuva de meteoros. Os dois aliens destroem o que sobrou da cidade, à procura de Kal-El.

5.02 - MORTAL

Jor-El tira os poderes de Clark, fazendo com que ele seja humano. Feliz por finalmente ser normal, Clark começa um namoro com Lana livre de segredos. Entretanto, depois que Lana, Jonathan e Martha são capturados como reféns por três bandidos, Clark deve descobrir como salvar sua família sem seus super poderes.

5.03 - HIDDEN

Chloe é avisada por Gabriel que ele vai lançar um míssel e destruir Smallville. Ainda sem seus poderes, Clark confronta Gabriel e acaba sendo baleado. No hospital, Clark morre e seu destino é deixado nas mãos de Jor-El. Enquanto isso, Lex acredita que Lionel tem a chave para abrir a nave.

5.04 - AQUA

Uma festa de verão no Crater Lake torna-se dramática quando Lois bate sua cabeça enquanto pula no lago. Antes que Clark pudesse salvá-la, um misterioso nadador, Aquaman, a.k.a. AC, chega para resgatá-la, nadando mais do que Clark e deixando-o surpreso. Professor Fine conta para Clark que Lex está por trás de uma operação secreta de manufaturamento de armas. A.C. invade o Centro Marinho da LuthorCorp em uma tentativa de destruir um dos torpedos de Lex e é capturado por Lex.

5.05 - THIRST

Lana decide se matricular na Universidade de Metropolis no último minuto e é forçada a entrar em uma fraternidade para encontrar um alojamento com tanto atraso. Entretanto, suas novas irmãs da fraternidade oferecem a ela mais do que um lugar para ficar depois de transformá-la em uma vampira e instruí-la a matar Clark. Enquanto isso, Chloe entra para um estágio no Daily Planet, mas a formidável editora do Daily Planet pode ser mais do que ela pode suportar.

5.06 - EXPOSED

Clark e Jonathan ficam surpresos quando o Senador Jake Jennings, um velho amigo de Jonathan, chega na fazenda procurando por apoio em sua campanha de reeleição. Entretanto, depois de uma jovem garota aparecer morta, é revelado que ela era uma stripper e amante de Jennings, o que faz ele ser o primeiro suspeito. Procurando por respostas, Chloe convence Lois a se disfarçar de stripper, mas as coisas tomam um rumo perigoso quando Lois é seqüestrada por um filho de diplomata que pretende vendê-la e torná-la escrava.

5.07 - SPLINTER

Clark é exposto a kryptonita de prata fazendo com que ele tenha ilusões paranóicas. A kryptonita de prata faz ele acreditar que Chloe vai revelar seu segredo, Jonathan está tramando algo contra ele com Lionel e Lex e Lana estão tendo um relacionamento secreto. Frenéticamente, Chloe e os Kents procuram por uma cura, mas é o Professor Fine que vem para o resgate de Clark - embora não sem um plano.

5.08 - SOLITUDE

Depois que Martha contrai uma estranha doença que lhe dá horas de vida, Clark recorre ao Professor Fine, que convence Clark que Jor-El é o único responsável pela doença dela e a única maneira de salvá-la é destruindo a Fortaleza da Solidão. Entretanto, quando os dois chegam na Fortaleza, Professor Fine tenta libertar Zod e matar Clark.

5.09 - LEXMAS

Lex consegue um envelope com informações prejudiciais que destruirá a vida de Jonathan e ele deve decidir se vai usar essas informações que também trarão danos a Clark e Martha. Antes de decidir o que fazer, Lex é baleado e entra em coma. Ele sonha que sua mãe o visita e mostra a ele a vida que ele poderia levar se se afastasse de seu pai (John Glover) e da Luthor Corp. Nessa vida alternativa, Lex está feliz e casado com Lana (Kristin Kreuk) e com um bebê a caminho. Enquanto isso, Chloe pede para Clark usar seus poderes para entregar presentes de Natal às crianças necessitadas.

5.10 - FANATIC

Jonathan recebe ameaças de vida de uma misteriosa fonte que deseja que ele desista da disputa pelo senado. Mais tarde, Clark encontra seu pai sangrando e machucado e fica determinado a encontrar o agressor. Depois ele descobre que um grupo de seguidores de Lex está determinado a fazer de tudo para garantir que Lex ganhe a eleição. A vida de Lois é ameaçada quando ela é capturada e avisada que deverá assassinar Jonathan durante o seu discurso. Lionel oferece dinheiro à Martha para ajudar na campanha de Jonathan. Lana se convence de que as respostas que ela está procurando estão na primeira chuva de meteoros.

5.11 - LOCKDOWN

Os dois policiais que testemunharam a aterrissagem da nave na chuva de meteoros, pegam Lex e Lana como reféns e ameaçam matá-los a menos que Lex revele onte ele escondeu a nave. Enquanto escapava pela "sala do pânico" (panic room), Lex leva um tiro que era destinado à Lana. Temendo que Lex possa sangrar até a morte, Lana pede para que ele conte aos policiais a localização secreta, mas ele confessa que a nave está desaparecida há semanas. Enquanto isso, Clark descobre que Lana tem pesquisado sobre a nave com Lex e teme que ela esteja próxima de descobrir seu segredo.

5.12 - RECKONING

No 100º episódio da série, Clark revela seu segredo para Lana, Jonathan e Lex conhecem o resultado da eleição para o senado e há um trágico acidente de carro na estrada que tira a vida de alguém que Clark ama. Desesperado, Clark apela para a ajuda de Jor-El.

5.13 - VENGEANCE

Clark descobre que uma nova repórter do Daily Planet - uma desajeitada mulher que usa óculos chamada Maya - é na verdade uma vingadora mascarada que luta contra o crime à noite. Enquanto isso, a dor reprimida de Clark o ameaça a fazer algo de errado.

5.14 - TOMB

O espírito de uma jovem garota é libertado depois que Lois encontra um cadáver nas paredes do Talon. Clark e Lois devem seguir as pistas do espírito e encontrar o assassino dela, que tem perseguido garotas de Smallville nos últimos 10 anos. Quando Lois é repentinamente sequestrada, Clark chega para resgatá-la.

5.15 - CYBORG

Um simpático doutor liberta um sujeito metade humano/metade máquina chamado Victor que estava sendo mantido preso e sofrendo experiências pela LuthorCorp. Enquanto tenta escapar, Victor é atingido pelo carro de Lana. Depois de vê-lo sair andando sem nenhum arranhão, Lana chama Clark para investigar. Clark se torna amigo de Victor e promete ajudá-lo a encontrar sua namorada, mas Lex (Michael Rosenbaum) arma uma cilada para Victor e o leva de volta para a LuthorCorp.

5.16 - HYPNOTIC

Lex descobre que Professor Fine, aka Brainiac está em Honduras e começa a confrontá-lo. Clark conhece uma linda mulher fatal chamada Simone que usa um charme mágico para fazer com que as pessoas cedam aos seus desejos. Um Clark enfeitiçado revela seus poderes para Simone, que aproveita a oportunidade e exige que Clark mate Lex.

5.17 - VOID

Ainda abalada pelo rompimento com Clark, Lana experimenta um soro perigoso que a faz entrar em coma e ver seus falecidos pais novamente. Um Clark preocupado corre pra salvar Lana de se machucar, mas acaba sendo injetado com um soro de kryptonita por um médico mau-cárater. Quando Clark entra em coma, ele consegue falar com seu pai Jonathan, morto recentemente, que o avisa que Lionel sabe seu segredo... enquanto isso, Lionel continua a se aproximar de Martha.

5.18 - FRAGILE

Clark e Martha recebem uma garotinha, Maddie, depois de sua mãe adotiva ser brutalmente esfaqueada até a morte. Entretanto, depois que descobre-se que Maddie tem o poder de quebrar vidros, ela se torna a primeira suspeita. Enquanto isso, Chloe surpreende Lex e Lana durante um momento íntimo...

5.19 - MERCY

Um torturador mascarado faz de Lionel refém e planeja uma série de jogos elaborados que Lionel deve ganhar pra se manter vivo. Depois que Clark conta a Martha que Lionel sabe seu segredo, ela vai confrontá-lo, mas inadvertidamente se torna um peão no jogo do torturador e acaba tendo que lutar por sua vida.

5.20 - FADE

Enquanto está em Metropolis, Clark salva a vida de um estranho chamado Graham, que promete retribuir Clark por sua generosidade. Infelizmente, Graham se revela ser um assassino com a habilidade de se camuflar e ele decide que matar Lex (Michael Rosenbaum) seria o melhor presente que ele poderia dar a Clark. Enquanto isso, Clark confronta Lana a respeito do relacionamento dela com Lex.